В ведении музея находится 7 памятников истории и культуры:
- памятник археологии "Древнерусский город Белоозеро " (на правом берегу р. Шексны, д. Каргулино);
- городище "Белозерский кремль";
- Спасо-Преображенский собор;
- церковь Ильи Пророка;
- церковь Спаса Всемилостивого;
- церковь Петра и Павла;
- церковь Иоанна Предтечи.
Структура музея:
- администрация музея;
- бухгалтерия;
- отдел фондов;
- отдел истории края;
- этнографический отдел;
- отдел природы;
- выставочной отдел ;
- просветительский отдел;
- литературный отдел (мемориальный дом-музей поэта С.С. Орлова);
- хозяйственный отдел;
- отдел безопасности;
- научная библиотека.
Площади:
- музей располагается на общей площади в 20,47 га;
- общая площадь музейных зданий-2754 кв.м;
- площадь фондохранилищ - 156 кв.м.;
- площадь экспозиционно-выставочных помещений-697 кв.м;
- площадь временных выставок-80 кв.м.
Количество сотрудников: 60, из них научных-20.
Посещение музея:
в 2006 г.- 22242 человека;
в 2007 г.- 28408 человек;
в 2008 г. - 32840 человек;
в 2009 г. - 33438 человек.